Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc5Q9QX29 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms