Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PolkQ9QUG2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PolkQ9QUG2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms