Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sfmbt1Q9JMD1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms