Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrac1Q9JKP8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms