Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AtrQ9JKK8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms