Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nectin1Q9JKF6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nectin1Q9JKF6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms