Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uchl3Q9JKB1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms