Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Alyref2Q9JJW6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms