Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms