Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl3Q9JJR7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms