Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfhx4Q9JJN2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfhx4Q9JJN2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms