Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc86Q9JJ89 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc86Q9JJ89 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms