Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms