Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn12Q9ET43 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms