Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rb1cc1Q9ESK9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms