Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trhr2Q9ERT2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms