Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn4aQ9ER60 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn4aQ9ER60 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms