Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SgshQ9EQ08 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms