Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf1Q9EPU4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf1Q9EPU4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf1Q9EPU4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms