Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms