Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd8Q9DA37 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd8Q9DA37 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms