Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tvp23bQ9D8T4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms