Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms