Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chmp5Q9D7S9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms