Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptp4a3Q9D658 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms