Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f1Q9D5Q6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms