Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms