Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgms2Q9D4B1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms