Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc2Q9D485 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms