Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms