Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stag1Q9D3E6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms