Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Snx20Q9D2Y5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Snx20Q9D2Y5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Snx20Q9D2Y5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Snx20Q9D2Y5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Snx20Q9D2Y5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx20Q9D2Y5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Snx20Q9D2Y5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Snx20Q9D2Y5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Snx20Q9D2Y5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Snx20Q9D2Y5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Snx20Q9D2Y5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Snx20Q9D2Y5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms