Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tssk3Q9D2E1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tssk3Q9D2E1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms