Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1lQ9D1E5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms