Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca7Q9D0M2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdca7Q9D0M2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms