Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Zbed3Q9D0L1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Zbed3Q9D0L1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Zbed3Q9D0L1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Zbed3Q9D0L1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Zbed3Q9D0L1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Zbed3Q9D0L1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
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Zbed3Q9D0L1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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