Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Utp11Q9CZJ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms