Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms