Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms