Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mgme1Q9CXC3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms