Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf1Q9CWX2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufaf1Q9CWX2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms