Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms