Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl28Q9CR40 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms