Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms