Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms