Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb3bpQ9CQ82 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3bpQ9CQ82 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms