Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms