Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms