Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim26Q99PN3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim26Q99PN3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim26Q99PN3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim26Q99PN3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms