Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rims1Q99NE5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms